Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms