Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms