Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.9 ms