Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms