Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms