Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUS3Q9BZE2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms