Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSDMCQ9BYG8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms