Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5DQ9BY66 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5DQ9BY66 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5DQ9BY66 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5DQ9BY66 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5DQ9BY66 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5DQ9BY66 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5DQ9BY66 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5DQ9BY66 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5DQ9BY66 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5DQ9BY66 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5DQ9BY66 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5DQ9BY66 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5DQ9BY66 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5DQ9BY66 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms