Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC8Q9BY41 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms