Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA7Q9BWT1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms