Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms