Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms