Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms