Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms