Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 GIMAP7-201ENST00000313543 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 PTP4A2-201ENST00000457805 1032 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AC022679.2-201ENST00000522186 813 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 SMIM8-207ENST00000608525 735 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AL031430.1-201ENST00000642067 1039 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms