Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms