Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM227BQ96M60 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM227BQ96M60 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM227BQ96M60 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM227BQ96M60 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM227BQ96M60 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM227BQ96M60 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM227BQ96M60 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM227BQ96M60 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM227BQ96M60 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM227BQ96M60 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM227BQ96M60 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM227BQ96M60 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM227BQ96M60 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms