Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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SAMD8Q96LT4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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SAMD8Q96LT4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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SAMD8Q96LT4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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SAMD8Q96LT4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SAMD8Q96LT4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SAMD8Q96LT4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SAMD8Q96LT4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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