Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms