Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms