Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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LRRC39Q96DD0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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LRRC39Q96DD0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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LRRC39Q96DD0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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LRRC39Q96DD0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC39Q96DD0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC39Q96DD0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC39Q96DD0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC39Q96DD0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC39Q96DD0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC39Q96DD0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC39Q96DD0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC39Q96DD0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC39Q96DD0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC39Q96DD0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC39Q96DD0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC39Q96DD0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC39Q96DD0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC39Q96DD0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC39Q96DD0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC39Q96DD0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC39Q96DD0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC39Q96DD0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC39Q96DD0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC39Q96DD0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC39Q96DD0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC39Q96DD0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC39Q96DD0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC39Q96DD0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC39Q96DD0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC39Q96DD0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC39Q96DD0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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