Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms