Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms