Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVE6

TMEM171, Transmembrane protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM171Q8WVE6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM171Q8WVE6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms