Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms