Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF397Q8NF99 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF397Q8NF99 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms