Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCG5

CHST4, Carbohydrate sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST4Q8NCG5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms