Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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CLIP4Q8N3C7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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