Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms