Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms