Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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USP43Q70EL4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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USP43Q70EL4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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