Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM47EQ6ZV65 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms