Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms