Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms