Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms