Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms