Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms