Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms