Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms