Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CARMIL1Q5VZK9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms