Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms