Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms