Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF6Q58WW2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms