Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDLIM3Q53GG5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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