Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKDCCQ504Y2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKDCCQ504Y2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKDCCQ504Y2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKDCCQ504Y2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms