Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms