Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AC015818.2-201ENST00000563569 840 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 TMEM138-202ENST00000381787 1205 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 RPL5-202ENST00000370321 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 WDYHV1-201ENST00000287387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 C11orf65-203ENST00000525729 1263 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AP005264.6-201ENST00000592801 414 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
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