Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms