Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SF1Q15637 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SF1Q15637 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SF1Q15637 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SF1Q15637 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SF1Q15637 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SF1Q15637 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SF1Q15637 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SF1Q15637 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SF1Q15637 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SF1Q15637 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SF1Q15637 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SF1Q15637 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SF1Q15637 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SF1Q15637 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SF1Q15637 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SF1Q15637 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SF1Q15637 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SF1Q15637 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SF1Q15637 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SF1Q15637 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SF1Q15637 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SF1Q15637 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SF1Q15637 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SF1Q15637 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SF1Q15637 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SF1Q15637 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SF1Q15637 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SF1Q15637 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SF1Q15637 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SF1Q15637 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SF1Q15637 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SF1Q15637 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SF1Q15637 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SF1Q15637 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SF1Q15637 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SF1Q15637 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SF1Q15637 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SF1Q15637 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SF1Q15637 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SF1Q15637 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SF1Q15637 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SF1Q15637 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SF1Q15637 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SF1Q15637 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SF1Q15637 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SF1Q15637 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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