Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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